Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PXDC1Q5TGL8 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.5 ms