Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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RDH8Q9NYR8 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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RDH8Q9NYR8 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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RDH8Q9NYR8 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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RDH8Q9NYR8 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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RDH8Q9NYR8 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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