Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIK3Q13003 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIK3Q13003 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIK3Q13003 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207 ms