Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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