Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms