Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GGA3Q9NZ52 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GGA3Q9NZ52 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GGA3Q9NZ52 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GGA3Q9NZ52 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GGA3Q9NZ52 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GGA3Q9NZ52 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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