Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.9 ms