Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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PKP4Q99569 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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PKP4Q99569 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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PKP4Q99569 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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PKP4Q99569 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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PKP4Q99569 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP4Q99569 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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