Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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FOXD4Q12950 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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FOXD4Q12950 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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