Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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