Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GGA3Q9NZ52 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.4 ms