Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RDH8Q9NYR8 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.2 ms