Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tor1aQ9ER39 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tor1aQ9ER39 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms