Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms