Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms