Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Efna3O08545 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efna3O08545 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms