Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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