Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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