Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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PTPRTO14522 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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PTPRTO14522 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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PTPRTO14522 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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PTPRTO14522 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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PTPRTO14522 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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PTPRTO14522 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPRTO14522 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPRTO14522 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPRTO14522 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPRTO14522 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRTO14522 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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