Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms