Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna3O08545 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efna3O08545 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna3O08545 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna3O08545 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Efna3O08545 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna3O08545 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna3O08545 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Efna3O08545 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efna3O08545 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms