Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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PTPN13Q12923 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PTPN13Q12923 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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