Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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