Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms