Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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