Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prf1P10820 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prf1P10820 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms