Protein–RNA interactions for Protein: P09793

Ctla4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla4P09793 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla4P09793 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla4P09793 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla4P09793 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla4P09793 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla4P09793 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctla4P09793 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctla4P09793 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctla4P09793 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctla4P09793 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla4P09793 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla4P09793 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla4P09793 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla4P09793 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla4P09793 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla4P09793 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla4P09793 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla4P09793 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla4P09793 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla4P09793 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla4P09793 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla4P09793 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms