Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna3O08545 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms