Protein–RNA interactions for Protein: B8JJD6

Fance, Fanconi anemia, complementation group E, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanceB8JJD6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FanceB8JJD6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanceB8JJD6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1031.4 ms