Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PnckQ9QYK9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PnckQ9QYK9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms