Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edf1Q9JMG1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms