Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pacs2Q3V3Q7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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