Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdr16c6Q05A13 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms