Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms