Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms