Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms