Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5538W4VSP6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5538W4VSP6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5538W4VSP6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm5538W4VSP6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5538W4VSP6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms