Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vstm4T1NXB5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Vstm4T1NXB5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vstm4T1NXB5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vstm4T1NXB5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vstm4T1NXB5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vstm4T1NXB5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms