Protein–RNA interactions for Protein: S4R1R7

Rpl9-ps1, MCG50795, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9-ps1S4R1R7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl9-ps1S4R1R7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl9-ps1S4R1R7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl9-ps1S4R1R7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpl9-ps1S4R1R7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms