Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2X1

Hnrnpf, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpfQ9Z2X1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HnrnpfQ9Z2X1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HnrnpfQ9Z2X1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HnrnpfQ9Z2X1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HnrnpfQ9Z2X1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HnrnpfQ9Z2X1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HnrnpfQ9Z2X1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HnrnpfQ9Z2X1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HnrnpfQ9Z2X1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HnrnpfQ9Z2X1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HnrnpfQ9Z2X1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HnrnpfQ9Z2X1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HnrnpfQ9Z2X1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HnrnpfQ9Z2X1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HnrnpfQ9Z2X1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms