Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Rlbp1Q9Z275 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rlbp1Q9Z275 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rlbp1Q9Z275 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rlbp1Q9Z275 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rlbp1Q9Z275 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rlbp1Q9Z275 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rlbp1Q9Z275 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rlbp1Q9Z275 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rlbp1Q9Z275 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rlbp1Q9Z275 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rlbp1Q9Z275 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rlbp1Q9Z275 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rlbp1Q9Z275 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rlbp1Q9Z275 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rlbp1Q9Z275 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rlbp1Q9Z275 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rlbp1Q9Z275 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rlbp1Q9Z275 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 329.8 ms