Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trip6Q9Z1Y4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trip6Q9Z1Y4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trip6Q9Z1Y4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trip6Q9Z1Y4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Trip6Q9Z1Y4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trip6Q9Z1Y4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trip6Q9Z1Y4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Trip6Q9Z1Y4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Trip6Q9Z1Y4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trip6Q9Z1Y4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trip6Q9Z1Y4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trip6Q9Z1Y4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trip6Q9Z1Y4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Trip6Q9Z1Y4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trip6Q9Z1Y4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trip6Q9Z1Y4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms