Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1F9

Uba2, SUMO-activating enzyme subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba2Q9Z1F9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uba2Q9Z1F9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uba2Q9Z1F9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uba2Q9Z1F9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uba2Q9Z1F9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uba2Q9Z1F9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uba2Q9Z1F9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba2Q9Z1F9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba2Q9Z1F9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uba2Q9Z1F9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Uba2Q9Z1F9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uba2Q9Z1F9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uba2Q9Z1F9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uba2Q9Z1F9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uba2Q9Z1F9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uba2Q9Z1F9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uba2Q9Z1F9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uba2Q9Z1F9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms