Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUS4

Gja10, Gap junction alpha-10 protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja10Q9WUS4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gja10Q9WUS4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gja10Q9WUS4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gja10Q9WUS4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gja10Q9WUS4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gja10Q9WUS4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gja10Q9WUS4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gja10Q9WUS4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gja10Q9WUS4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gja10Q9WUS4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gja10Q9WUS4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gja10Q9WUS4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gja10Q9WUS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gja10Q9WUS4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gja10Q9WUS4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms