Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUN8

Lbx2, Transcription factor LBX2, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx2Q9WUN8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lbx2Q9WUN8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lbx2Q9WUN8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lbx2Q9WUN8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lbx2Q9WUN8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms