Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim10Q9WUH5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim10Q9WUH5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim10Q9WUH5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim10Q9WUH5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim10Q9WUH5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim10Q9WUH5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim10Q9WUH5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim10Q9WUH5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim10Q9WUH5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim10Q9WUH5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim10Q9WUH5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim10Q9WUH5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim10Q9WUH5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim10Q9WUH5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim10Q9WUH5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim10Q9WUH5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim10Q9WUH5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim10Q9WUH5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim10Q9WUH5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim10Q9WUH5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim10Q9WUH5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim10Q9WUH5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim10Q9WUH5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim10Q9WUH5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim10Q9WUH5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim10Q9WUH5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim10Q9WUH5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim10Q9WUH5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim10Q9WUH5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim10Q9WUH5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim10Q9WUH5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms