Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF1

Vmn1r49, Vomeronasal type-1 receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r49Q9WUF1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r49Q9WUF1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r49Q9WUF1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r49Q9WUF1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r49Q9WUF1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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