Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbck1Q9WUB0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbck1Q9WUB0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rbck1Q9WUB0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbck1Q9WUB0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms