Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTQ8

Timm23, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm23Q9WTQ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Timm23Q9WTQ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Timm23Q9WTQ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm23Q9WTQ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timm23Q9WTQ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm23Q9WTQ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm23Q9WTQ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms