Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Fam50bQ9WTJ8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Fam50bQ9WTJ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Fam50bQ9WTJ8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Fam50bQ9WTJ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Fam50bQ9WTJ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fam50bQ9WTJ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms